MKV Kapitelmarken bearbeiten

Ich habe von einem meiner Freunde einige HD-Mitschnitte von Spielen der letzten Fußball-WM bekommen und wollte sie nun mir gerne ansehen. Die Dateien, die ich bekommen habe, waren im MKV-Format und besaßen bereits einige Kapitelmarken etwa bei Toren und der Halbzeit zum einfachen navigieren. Nun sind die Kapitelmarken teilweise so unsauber geworden, dass ich immer, wenn ich ein Kapitel der MKV auf meinem Western-Digital-Mediaplayer, erst 10 bis 20 Sekunden zurückspulen muss, um die Szene auch wirklich zu sehen.

Deswegen würde ich gerne am PC die Kapitel in der MKV-Datei so bearbeiten, dass die Kapitelmarken wieder stimmen. Welches Programm benötige ich dafür? Muss ich die Filmdateien erst aus dem MKV-Container extrahieren? Oder kann es ein Program "on-the-fly"? Ich habe als Videobearbeitung Adobe Premiere Elements und Magix Video X zur Verfügung, falls das hilft.